水产养殖目前还处在以野生物种驯化养殖为主、人工遗传改良品种为辅的生产阶段。由于无意识地近亲繁殖，导致很多养殖品种的种质从20世纪80年代就相继出现退化现象。国家因此设计了国家级水产原良种场、引种中心和遗传育种中心三条良种化的技术路线，来解决苗种繁殖场优质亲本的生产供应难题。

 

    从20世纪90年代初开始，我国有计划、大规模地推进水产品种创新和原良种体系建设，特别是1998年以来，中央财政建立了全国水产良种工程基本建设专项，加大对水产种业的支持力度，促进了水产原良种体系形成和完善。截止到2013年，已经建立了65家国家级的原种场、良种场，575家省级水产原良种场，目前正在建的水产种业示范场超过60个。而从上个世纪90年代开始成立的国家水产原良种审定委员会，直到2014年一共审定了156个新品种，2015年又审定了12个新品种(具体要等到2016年3月发布)。每一个良种都或多或少会带动相应产业链的发展。

 

    但良种不是“万金油”，并非可以满足养殖者对高频养殖和高产的极限化追求。越来越多的迹象表明，病害的爆发跟养殖者的养殖模式息息相关。比如江苏的鲫鱼，因为此前养殖效益比较好，导致一些养殖户养殖量越来越大，忽视了养殖和环境的平衡。过去的养殖是春夏秋养殖，冬季干塘、晒塘，让池塘有一个修复的过程，但现在很多地方都是一年四季不间断在养，导致一些病菌不断滋生。再者，高密度的养殖对鱼本身的免疫系统造成损害，先天性免疫系统长期趋于一种高应激状态。当爆发严重病害时，鱼类自身没有潜能去启动免疫反应来抵抗各种病原的侵袭，从而导致出现一些新型病例，并诱发出其它一些病害。